Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFAP58Q5T655 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CFAP58Q5T655 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFAP58Q5T655 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CFAP58Q5T655 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP58Q5T655 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFAP58Q5T655 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFAP58Q5T655 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP58Q5T655 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP58Q5T655 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP58Q5T655 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CFAP58Q5T655 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CFAP58Q5T655 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFAP58Q5T655 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFAP58Q5T655 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CFAP58Q5T655 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CFAP58Q5T655 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CFAP58Q5T655 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CFAP58Q5T655 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CFAP58Q5T655 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CFAP58Q5T655 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CFAP58Q5T655 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CFAP58Q5T655 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CFAP58Q5T655 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CFAP58Q5T655 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CFAP58Q5T655 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CFAP58Q5T655 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CFAP58Q5T655 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CFAP58Q5T655 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CFAP58Q5T655 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CFAP58Q5T655 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CFAP58Q5T655 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CFAP58Q5T655 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CFAP58Q5T655 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CFAP58Q5T655 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CFAP58Q5T655 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CFAP58Q5T655 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CFAP58Q5T655 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CFAP58Q5T655 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CFAP58Q5T655 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CFAP58Q5T655 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFAP58Q5T655 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CFAP58Q5T655 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CFAP58Q5T655 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CFAP58Q5T655 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CFAP58Q5T655 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CFAP58Q5T655 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CFAP58Q5T655 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CFAP58Q5T655 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CFAP58Q5T655 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CFAP58Q5T655 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CFAP58Q5T655 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CFAP58Q5T655 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFAP58Q5T655 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CFAP58Q5T655 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CFAP58Q5T655 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP58Q5T655 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP58Q5T655 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP58Q5T655 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CFAP58Q5T655 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CFAP58Q5T655 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CFAP58Q5T655 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CFAP58Q5T655 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CFAP58Q5T655 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CFAP58Q5T655 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CFAP58Q5T655 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CFAP58Q5T655 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CFAP58Q5T655 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFAP58Q5T655 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFAP58Q5T655 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CFAP58Q5T655 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFAP58Q5T655 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CFAP58Q5T655 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CFAP58Q5T655 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CFAP58Q5T655 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CFAP58Q5T655 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CFAP58Q5T655 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CFAP58Q5T655 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CFAP58Q5T655 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CFAP58Q5T655 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CFAP58Q5T655 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CFAP58Q5T655 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CFAP58Q5T655 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP58Q5T655 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP58Q5T655 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP58Q5T655 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP58Q5T655 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP58Q5T655 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CFAP58Q5T655 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms