Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM48Q5RL73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM48Q5RL73 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM48Q5RL73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM48Q5RL73 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM48Q5RL73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBM48Q5RL73 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM48Q5RL73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM48Q5RL73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms