Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9K5

ZMAT1, Zinc finger matrin-type protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT1Q5H9K5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZMAT1Q5H9K5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZMAT1Q5H9K5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZMAT1Q5H9K5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZMAT1Q5H9K5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZMAT1Q5H9K5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZMAT1Q5H9K5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZMAT1Q5H9K5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZMAT1Q5H9K5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms