Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAN3Q58A45 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAN3Q58A45 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAN3Q58A45 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAN3Q58A45 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAN3Q58A45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAN3Q58A45 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PAN3Q58A45 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN3Q58A45 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN3Q58A45 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms