Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDUFAF6Q330K2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFAF6Q330K2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFAF6Q330K2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFAF6Q330K2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDUFAF6Q330K2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDUFAF6Q330K2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDUFAF6Q330K2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFAF6Q330K2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFAF6Q330K2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFAF6Q330K2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFAF6Q330K2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFAF6Q330K2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms