Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRADDQ15628 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRADDQ15628 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRADDQ15628 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRADDQ15628 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRADDQ15628 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRADDQ15628 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRADDQ15628 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRADDQ15628 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRADDQ15628 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRADDQ15628 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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