Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKD1Q15139 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKD1Q15139 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKD1Q15139 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKD1Q15139 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKD1Q15139 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKD1Q15139 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKD1Q15139 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRKD1Q15139 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKD1Q15139 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRKD1Q15139 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKD1Q15139 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD1Q15139 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKD1Q15139 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKD1Q15139 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKD1Q15139 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD1Q15139 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD1Q15139 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKD1Q15139 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKD1Q15139 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRKD1Q15139 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKD1Q15139 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKD1Q15139 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKD1Q15139 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms