Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SNX17Q15036 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX17Q15036 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX17Q15036 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX17Q15036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX17Q15036 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNX17Q15036 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SNX17Q15036 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SNX17Q15036 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX17Q15036 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX17Q15036 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNX17Q15036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNX17Q15036 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNX17Q15036 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNX17Q15036 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SNX17Q15036 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX17Q15036 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNX17Q15036 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX17Q15036 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms