Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SNX17Q15036 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SNX17Q15036 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SNX17Q15036 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SNX17Q15036 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SNX17Q15036 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SNX17Q15036 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SNX17Q15036 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SNX17Q15036 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SNX17Q15036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SNX17Q15036 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
SNX17Q15036 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SNX17Q15036 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SNX17Q15036 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SNX17Q15036 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SNX17Q15036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNX17Q15036 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SNX17Q15036 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SNX17Q15036 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SNX17Q15036 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SNX17Q15036 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SNX17Q15036 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SNX17Q15036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNX17Q15036 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNX17Q15036 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SNX17Q15036 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SNX17Q15036 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SNX17Q15036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SNX17Q15036 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SNX17Q15036 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SNX17Q15036 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SNX17Q15036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SNX17Q15036 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SNX17Q15036 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SNX17Q15036 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SNX17Q15036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SNX17Q15036 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SNX17Q15036 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SNX17Q15036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNX17Q15036 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SNX17Q15036 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SNX17Q15036 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SNX17Q15036 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SNX17Q15036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SNX17Q15036 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SNX17Q15036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SNX17Q15036 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNX17Q15036 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNX17Q15036 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNX17Q15036 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNX17Q15036 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNX17Q15036 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNX17Q15036 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNX17Q15036 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNX17Q15036 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNX17Q15036 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNX17Q15036 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SNX17Q15036 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SNX17Q15036 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNX17Q15036 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNX17Q15036 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNX17Q15036 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNX17Q15036 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SNX17Q15036 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SNX17Q15036 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNX17Q15036 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNX17Q15036 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SNX17Q15036 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNX17Q15036 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SNX17Q15036 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNX17Q15036 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SNX17Q15036 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNX17Q15036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SNX17Q15036 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SNX17Q15036 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SNX17Q15036 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SNX17Q15036 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNX17Q15036 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SNX17Q15036 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SNX17Q15036 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SNX17Q15036 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SNX17Q15036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SNX17Q15036 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SNX17Q15036 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SNX17Q15036 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNX17Q15036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SNX17Q15036 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SNX17Q15036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SNX17Q15036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
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