Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF3Q14653 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF3Q14653 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF3Q14653 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF3Q14653 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF3Q14653 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF3Q14653 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF3Q14653 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF3Q14653 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms