Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CKAP4Q07065 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CKAP4Q07065 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKAP4Q07065 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CKAP4Q07065 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CKAP4Q07065 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CKAP4Q07065 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKAP4Q07065 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKAP4Q07065 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKAP4Q07065 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CKAP4Q07065 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CKAP4Q07065 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms