Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CYP27A1Q02318 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP27A1Q02318 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CYP27A1Q02318 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CYP27A1Q02318 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP27A1Q02318 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP27A1Q02318 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CYP27A1Q02318 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP27A1Q02318 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP27A1Q02318 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP27A1Q02318 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms