Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP2R2BQ00005 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP2R2BQ00005 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP2R2BQ00005 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP2R2BQ00005 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP2R2BQ00005 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP2R2BQ00005 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP2R2BQ00005 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP2R2BQ00005 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP2R2BQ00005 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPP2R2BQ00005 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP2R2BQ00005 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms