Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIM1P81133 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIM1P81133 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIM1P81133 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIM1P81133 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIM1P81133 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIM1P81133 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIM1P81133 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIM1P81133 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIM1P81133 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIM1P81133 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIM1P81133 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIM1P81133 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIM1P81133 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIM1P81133 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM1P81133 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM1P81133 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM1P81133 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM1P81133 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIM1P81133 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIM1P81133 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIM1P81133 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIM1P81133 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIM1P81133 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM1P81133 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM1P81133 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIM1P81133 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIM1P81133 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIM1P81133 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM1P81133 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM1P81133 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM1P81133 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM1P81133 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIM1P81133 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SIM1P81133 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SIM1P81133 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SIM1P81133 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SIM1P81133 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SIM1P81133 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIM1P81133 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SIM1P81133 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SIM1P81133 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIM1P81133 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIM1P81133 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIM1P81133 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIM1P81133 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIM1P81133 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIM1P81133 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIM1P81133 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIM1P81133 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIM1P81133 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SIM1P81133 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIM1P81133 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIM1P81133 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIM1P81133 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIM1P81133 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIM1P81133 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIM1P81133 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIM1P81133 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIM1P81133 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIM1P81133 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIM1P81133 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIM1P81133 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIM1P81133 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIM1P81133 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIM1P81133 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIM1P81133 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIM1P81133 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIM1P81133 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIM1P81133 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIM1P81133 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIM1P81133 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIM1P81133 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIM1P81133 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIM1P81133 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIM1P81133 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIM1P81133 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIM1P81133 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIM1P81133 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIM1P81133 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SIM1P81133 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIM1P81133 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIM1P81133 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIM1P81133 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIM1P81133 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIM1P81133 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIM1P81133 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIM1P81133 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIM1P81133 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms