Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPXP78539 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRPXP78539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRPXP78539 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPXP78539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRPXP78539 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPXP78539 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRPXP78539 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPXP78539 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPXP78539 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRPXP78539 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRPXP78539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPXP78539 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRPXP78539 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRPXP78539 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRPXP78539 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRPXP78539 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRPXP78539 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPXP78539 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPXP78539 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRPXP78539 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPXP78539 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRPXP78539 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPXP78539 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPXP78539 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRPXP78539 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPXP78539 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRPXP78539 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPXP78539 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPXP78539 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPXP78539 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPXP78539 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRPXP78539 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRPXP78539 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPXP78539 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPXP78539 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPXP78539 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPXP78539 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPXP78539 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPXP78539 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPXP78539 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPXP78539 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPXP78539 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPXP78539 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPXP78539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPXP78539 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPXP78539 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPXP78539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPXP78539 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPXP78539 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPXP78539 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPXP78539 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRPXP78539 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPXP78539 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPXP78539 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRPXP78539 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPXP78539 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRPXP78539 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRPXP78539 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRPXP78539 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPXP78539 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPXP78539 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRPXP78539 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPXP78539 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPXP78539 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRPXP78539 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPXP78539 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPXP78539 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPXP78539 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPXP78539 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPXP78539 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPXP78539 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPXP78539 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPXP78539 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPXP78539 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPXP78539 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPXP78539 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPXP78539 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPXP78539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPXP78539 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPXP78539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRPXP78539 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPXP78539 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPXP78539 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPXP78539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRPXP78539 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms