Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB4BP68371 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBB4BP68371 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB4BP68371 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB4BP68371 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUBB4BP68371 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUBB4BP68371 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBB4BP68371 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBB4BP68371 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms