Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL23AP62750 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL23AP62750 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL23AP62750 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL23AP62750 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL23AP62750 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL23AP62750 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL23AP62750 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL23AP62750 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms