Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS4XP62701 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS4XP62701 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS4XP62701 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS4XP62701 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4XP62701 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS4XP62701 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS4XP62701 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS4XP62701 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4XP62701 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4XP62701 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4XP62701 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms