Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMFBP60983 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMFBP60983 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GMFBP60983 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GMFBP60983 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMFBP60983 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMFBP60983 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GMFBP60983 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMFBP60983 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMFBP60983 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMFBP60983 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMFBP60983 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMFBP60983 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMFBP60983 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMFBP60983 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMFBP60983 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMFBP60983 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMFBP60983 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMFBP60983 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMFBP60983 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMFBP60983 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMFBP60983 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMFBP60983 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMFBP60983 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMFBP60983 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GMFBP60983 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMFBP60983 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GMFBP60983 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMFBP60983 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GMFBP60983 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GMFBP60983 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMFBP60983 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GMFBP60983 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMFBP60983 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GMFBP60983 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMFBP60983 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMFBP60983 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GMFBP60983 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMFBP60983 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GMFBP60983 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMFBP60983 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMFBP60983 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMFBP60983 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GMFBP60983 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMFBP60983 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GMFBP60983 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GMFBP60983 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GMFBP60983 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMFBP60983 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMFBP60983 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMFBP60983 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMFBP60983 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GMFBP60983 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMFBP60983 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMFBP60983 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMFBP60983 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMFBP60983 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMFBP60983 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMFBP60983 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMFBP60983 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMFBP60983 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMFBP60983 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMFBP60983 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMFBP60983 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMFBP60983 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMFBP60983 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMFBP60983 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMFBP60983 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMFBP60983 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMFBP60983 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GMFBP60983 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMFBP60983 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMFBP60983 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMFBP60983 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMFBP60983 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMFBP60983 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMFBP60983 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMFBP60983 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMFBP60983 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMFBP60983 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMFBP60983 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMFBP60983 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMFBP60983 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMFBP60983 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMFBP60983 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GMFBP60983 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMFBP60983 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMFBP60983 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMFBP60983 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GMFBP60983 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMFBP60983 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMFBP60983 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMFBP60983 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMFBP60983 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMFBP60983 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMFBP60983 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMFBP60983 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMFBP60983 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMFBP60983 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMFBP60983 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms