Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSDMDP57764 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GSDMDP57764 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GSDMDP57764 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GSDMDP57764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GSDMDP57764 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GSDMDP57764 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GSDMDP57764 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GSDMDP57764 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSDMDP57764 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSDMDP57764 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GSDMDP57764 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GSDMDP57764 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSDMDP57764 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMDP57764 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms