Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
AFDNP55196 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
AFDNP55196 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
AFDNP55196 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
AFDNP55196 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
AFDNP55196 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
AFDNP55196 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
AFDNP55196 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
AFDNP55196 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
AFDNP55196 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
AFDNP55196 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
AFDNP55196 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
AFDNP55196 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
AFDNP55196 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
AFDNP55196 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
AFDNP55196 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
AFDNP55196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
AFDNP55196 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
AFDNP55196 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
AFDNP55196 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
AFDNP55196 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
AFDNP55196 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
AFDNP55196 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
AFDNP55196 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
AFDNP55196 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AFDNP55196 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AFDNP55196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
AFDNP55196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
AFDNP55196 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AFDNP55196 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
AFDNP55196 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
AFDNP55196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AFDNP55196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AFDNP55196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
AFDNP55196 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
AFDNP55196 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AFDNP55196 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
AFDNP55196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AFDNP55196 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AFDNP55196 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
AFDNP55196 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
AFDNP55196 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
AFDNP55196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
AFDNP55196 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
AFDNP55196 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AFDNP55196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AFDNP55196 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
AFDNP55196 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
AFDNP55196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
AFDNP55196 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
AFDNP55196 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
AFDNP55196 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
AFDNP55196 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
AFDNP55196 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
AFDNP55196 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
AFDNP55196 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
AFDNP55196 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
AFDNP55196 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AFDNP55196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
AFDNP55196 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
AFDNP55196 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
AFDNP55196 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
AFDNP55196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
AFDNP55196 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
AFDNP55196 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
AFDNP55196 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
AFDNP55196 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
AFDNP55196 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
AFDNP55196 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
AFDNP55196 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
AFDNP55196 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
AFDNP55196 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
AFDNP55196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
AFDNP55196 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AFDNP55196 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
AFDNP55196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
AFDNP55196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
AFDNP55196 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
AFDNP55196 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
AFDNP55196 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
AFDNP55196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
AFDNP55196 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
AFDNP55196 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
AFDNP55196 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
AFDNP55196 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
AFDNP55196 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AFDNP55196 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
AFDNP55196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
AFDNP55196 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
AFDNP55196 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
AFDNP55196 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
AFDNP55196 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AFDNP55196 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
AFDNP55196 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AFDNP55196 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
AFDNP55196 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
AFDNP55196 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
AFDNP55196 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
AFDNP55196 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
AFDNP55196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms