Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A2P55011 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC12A2P55011 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A2P55011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A2P55011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC12A2P55011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC12A2P55011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC12A2P55011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A2P55011 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A2P55011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A2P55011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A2P55011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A2P55011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms