Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC18A1P54219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC18A1P54219 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC18A1P54219 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC18A1P54219 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC18A1P54219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC18A1P54219 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC18A1P54219 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC18A1P54219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC18A1P54219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms