Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CDR1P51861 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDR1P51861 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDR1P51861 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDR1P51861 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDR1P51861 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDR1P51861 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDR1P51861 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDR1P51861 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDR1P51861 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDR1P51861 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDR1P51861 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CDR1P51861 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDR1P51861 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDR1P51861 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDR1P51861 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDR1P51861 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDR1P51861 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDR1P51861 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDR1P51861 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDR1P51861 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDR1P51861 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDR1P51861 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDR1P51861 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDR1P51861 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDR1P51861 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDR1P51861 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDR1P51861 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDR1P51861 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CDR1P51861 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDR1P51861 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDR1P51861 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDR1P51861 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDR1P51861 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDR1P51861 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDR1P51861 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CDR1P51861 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDR1P51861 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDR1P51861 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDR1P51861 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDR1P51861 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDR1P51861 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDR1P51861 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDR1P51861 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDR1P51861 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDR1P51861 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDR1P51861 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CDR1P51861 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDR1P51861 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDR1P51861 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDR1P51861 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDR1P51861 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CDR1P51861 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CDR1P51861 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CDR1P51861 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms