Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNQ1P51787 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNQ1P51787 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNQ1P51787 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNQ1P51787 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNQ1P51787 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNQ1P51787 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNQ1P51787 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNQ1P51787 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNQ1P51787 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNQ1P51787 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNQ1P51787 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNQ1P51787 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNQ1P51787 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms