Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASCL1P50553 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASCL1P50553 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ASCL1P50553 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ASCL1P50553 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ASCL1P50553 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASCL1P50553 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASCL1P50553 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASCL1P50553 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms