Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFCP49767 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFCP49767 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFCP49767 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VEGFCP49767 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VEGFCP49767 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VEGFCP49767 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFCP49767 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms