Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM4P49221 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM4P49221 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGM4P49221 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGM4P49221 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGM4P49221 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM4P49221 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM4P49221 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM4P49221 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM4P49221 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM4P49221 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM4P49221 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM4P49221 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM4P49221 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM4P49221 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM4P49221 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM4P49221 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM4P49221 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM4P49221 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM4P49221 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM4P49221 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM4P49221 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM4P49221 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM4P49221 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM4P49221 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM4P49221 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM4P49221 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM4P49221 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM4P49221 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGM4P49221 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGM4P49221 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGM4P49221 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGM4P49221 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM4P49221 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM4P49221 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM4P49221 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGM4P49221 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM4P49221 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGM4P49221 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGM4P49221 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM4P49221 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM4P49221 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGM4P49221 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM4P49221 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM4P49221 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TGM4P49221 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGM4P49221 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TGM4P49221 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TGM4P49221 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGM4P49221 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGM4P49221 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGM4P49221 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM4P49221 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM4P49221 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM4P49221 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGM4P49221 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGM4P49221 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGM4P49221 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGM4P49221 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGM4P49221 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGM4P49221 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TGM4P49221 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM4P49221 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM4P49221 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM4P49221 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TGM4P49221 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TGM4P49221 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TGM4P49221 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM4P49221 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM4P49221 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TGM4P49221 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGM4P49221 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TGM4P49221 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TGM4P49221 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TGM4P49221 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TGM4P49221 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TGM4P49221 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TGM4P49221 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TGM4P49221 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGM4P49221 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TGM4P49221 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM4P49221 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TGM4P49221 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGM4P49221 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TGM4P49221 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM4P49221 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM4P49221 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM4P49221 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TGM4P49221 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TGM4P49221 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM4P49221 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TGM4P49221 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TGM4P49221 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM4P49221 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TGM4P49221 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms