Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNNT3P45378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNNT3P45378 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNNT3P45378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNNT3P45378 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNT3P45378 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNT3P45378 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNT3P45378 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNNT3P45378 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNT3P45378 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms