Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC1A3P43003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC1A3P43003 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A3P43003 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A3P43003 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A3P43003 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A3P43003 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A3P43003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A3P43003 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A3P43003 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms