Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN7P41732 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN7P41732 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN7P41732 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSPAN7P41732 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSPAN7P41732 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSPAN7P41732 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSPAN7P41732 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSPAN7P41732 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms