Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP8P40818 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP8P40818 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP8P40818 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP8P40818 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP8P40818 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP8P40818 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP8P40818 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP8P40818 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP8P40818 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP8P40818 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP8P40818 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP8P40818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP8P40818 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP8P40818 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP8P40818 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP8P40818 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP8P40818 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP8P40818 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP8P40818 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP8P40818 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP8P40818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP8P40818 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP8P40818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP8P40818 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP8P40818 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
USP8P40818 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP8P40818 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP8P40818 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP8P40818 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP8P40818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP8P40818 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP8P40818 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP8P40818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP8P40818 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP8P40818 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP8P40818 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP8P40818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP8P40818 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP8P40818 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
USP8P40818 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP8P40818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP8P40818 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP8P40818 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP8P40818 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP8P40818 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP8P40818 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP8P40818 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USP8P40818 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP8P40818 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP8P40818 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP8P40818 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP8P40818 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP8P40818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP8P40818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP8P40818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP8P40818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP8P40818 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP8P40818 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP8P40818 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP8P40818 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
USP8P40818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP8P40818 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP8P40818 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP8P40818 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP8P40818 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP8P40818 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP8P40818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP8P40818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP8P40818 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP8P40818 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP8P40818 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP8P40818 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP8P40818 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP8P40818 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP8P40818 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP8P40818 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP8P40818 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP8P40818 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP8P40818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP8P40818 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP8P40818 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP8P40818 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP8P40818 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP8P40818 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP8P40818 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP8P40818 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP8P40818 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP8P40818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP8P40818 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP8P40818 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP8P40818 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP8P40818 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USP8P40818 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms