Protein–RNA interactions for Protein: P39905

GDNF, Glial cell line-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDNFP39905 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDNFP39905 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDNFP39905 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDNFP39905 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDNFP39905 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GDNFP39905 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDNFP39905 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDNFP39905 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDNFP39905 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDNFP39905 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDNFP39905 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDNFP39905 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDNFP39905 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDNFP39905 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDNFP39905 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDNFP39905 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDNFP39905 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDNFP39905 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDNFP39905 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDNFP39905 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDNFP39905 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDNFP39905 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDNFP39905 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDNFP39905 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDNFP39905 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDNFP39905 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDNFP39905 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDNFP39905 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDNFP39905 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDNFP39905 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDNFP39905 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDNFP39905 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDNFP39905 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDNFP39905 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDNFP39905 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDNFP39905 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDNFP39905 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDNFP39905 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDNFP39905 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDNFP39905 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDNFP39905 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDNFP39905 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDNFP39905 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDNFP39905 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDNFP39905 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDNFP39905 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDNFP39905 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDNFP39905 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDNFP39905 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDNFP39905 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDNFP39905 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDNFP39905 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDNFP39905 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDNFP39905 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDNFP39905 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GDNFP39905 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDNFP39905 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDNFP39905 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDNFP39905 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GDNFP39905 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDNFP39905 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDNFP39905 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDNFP39905 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDNFP39905 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDNFP39905 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDNFP39905 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDNFP39905 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDNFP39905 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDNFP39905 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDNFP39905 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDNFP39905 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDNFP39905 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDNFP39905 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDNFP39905 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDNFP39905 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDNFP39905 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDNFP39905 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDNFP39905 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GDNFP39905 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDNFP39905 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDNFP39905 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDNFP39905 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDNFP39905 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDNFP39905 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDNFP39905 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms