Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA7P36544 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNA7P36544 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA7P36544 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNA7P36544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHRNA7P36544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRNA7P36544 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNA7P36544 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNA7P36544 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms