Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFN2P35080 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFN2P35080 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFN2P35080 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFN2P35080 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFN2P35080 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFN2P35080 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFN2P35080 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFN2P35080 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFN2P35080 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFN2P35080 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFN2P35080 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFN2P35080 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFN2P35080 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFN2P35080 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFN2P35080 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFN2P35080 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFN2P35080 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFN2P35080 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFN2P35080 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFN2P35080 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PFN2P35080 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFN2P35080 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFN2P35080 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PFN2P35080 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFN2P35080 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PFN2P35080 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PFN2P35080 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFN2P35080 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFN2P35080 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PFN2P35080 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFN2P35080 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PFN2P35080 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFN2P35080 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PFN2P35080 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PFN2P35080 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFN2P35080 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PFN2P35080 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PFN2P35080 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PFN2P35080 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PFN2P35080 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PFN2P35080 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFN2P35080 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFN2P35080 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFN2P35080 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PFN2P35080 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFN2P35080 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PFN2P35080 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFN2P35080 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFN2P35080 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFN2P35080 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PFN2P35080 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFN2P35080 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFN2P35080 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFN2P35080 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PFN2P35080 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PFN2P35080 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFN2P35080 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFN2P35080 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFN2P35080 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PFN2P35080 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFN2P35080 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFN2P35080 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFN2P35080 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PFN2P35080 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PFN2P35080 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PFN2P35080 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PFN2P35080 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PFN2P35080 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PFN2P35080 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PFN2P35080 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PFN2P35080 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFN2P35080 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFN2P35080 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFN2P35080 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PFN2P35080 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFN2P35080 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFN2P35080 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PFN2P35080 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFN2P35080 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFN2P35080 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFN2P35080 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PFN2P35080 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFN2P35080 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFN2P35080 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFN2P35080 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PFN2P35080 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFN2P35080 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFN2P35080 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PFN2P35080 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFN2P35080 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PFN2P35080 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFN2P35080 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PFN2P35080 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PFN2P35080 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms