Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD6P30203 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD6P30203 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD6P30203 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CD6P30203 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD6P30203 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD6P30203 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD6P30203 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD6P30203 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD6P30203 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD6P30203 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD6P30203 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD6P30203 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD6P30203 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CD6P30203 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CD6P30203 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CD6P30203 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD6P30203 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CD6P30203 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD6P30203 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD6P30203 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD6P30203 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD6P30203 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD6P30203 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD6P30203 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD6P30203 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD6P30203 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD6P30203 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD6P30203 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD6P30203 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD6P30203 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD6P30203 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD6P30203 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD6P30203 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD6P30203 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD6P30203 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD6P30203 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD6P30203 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD6P30203 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD6P30203 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD6P30203 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD6P30203 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD6P30203 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CD6P30203 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD6P30203 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD6P30203 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD6P30203 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD6P30203 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD6P30203 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD6P30203 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD6P30203 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD6P30203 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD6P30203 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD6P30203 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CD6P30203 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD6P30203 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD6P30203 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD6P30203 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD6P30203 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD6P30203 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD6P30203 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD6P30203 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD6P30203 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD6P30203 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD6P30203 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD6P30203 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD6P30203 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD6P30203 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CD6P30203 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD6P30203 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD6P30203 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD6P30203 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CD6P30203 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD6P30203 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD6P30203 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD6P30203 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD6P30203 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD6P30203 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD6P30203 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD6P30203 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CD6P30203 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD6P30203 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD6P30203 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD6P30203 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CD6P30203 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms