Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SSFA2P28290 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SSFA2P28290 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SSFA2P28290 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SSFA2P28290 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SSFA2P28290 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SSFA2P28290 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SSFA2P28290 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SSFA2P28290 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SSFA2P28290 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SSFA2P28290 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SSFA2P28290 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SSFA2P28290 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SSFA2P28290 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SSFA2P28290 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SSFA2P28290 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SSFA2P28290 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SSFA2P28290 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SSFA2P28290 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
SSFA2P28290 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SSFA2P28290 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SSFA2P28290 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms