Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.41■■■■■ 4.7
SSFA2P28290 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SSFA2P28290 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SSFA2P28290 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
SSFA2P28290 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SSFA2P28290 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
SSFA2P28290 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
SSFA2P28290 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SSFA2P28290 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SSFA2P28290 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SSFA2P28290 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SSFA2P28290 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SSFA2P28290 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SSFA2P28290 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
SSFA2P28290 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SSFA2P28290 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SSFA2P28290 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SSFA2P28290 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SSFA2P28290 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SSFA2P28290 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SSFA2P28290 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
SSFA2P28290 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.93■■■■■ 4.14
SSFA2P28290 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
SSFA2P28290 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SSFA2P28290 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SSFA2P28290 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SSFA2P28290 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SSFA2P28290 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SSFA2P28290 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SSFA2P28290 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SSFA2P28290 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
SSFA2P28290 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SSFA2P28290 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SSFA2P28290 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SSFA2P28290 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SSFA2P28290 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.03■■■■■ 4
SSFA2P28290 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SSFA2P28290 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SSFA2P28290 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SSFA2P28290 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SSFA2P28290 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
SSFA2P28290 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SSFA2P28290 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SSFA2P28290 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SSFA2P28290 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SSFA2P28290 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SSFA2P28290 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SSFA2P28290 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SSFA2P28290 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SSFA2P28290 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SSFA2P28290 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SSFA2P28290 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SSFA2P28290 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SSFA2P28290 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SSFA2P28290 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SSFA2P28290 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SSFA2P28290 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SSFA2P28290 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SSFA2P28290 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SSFA2P28290 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SSFA2P28290 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SSFA2P28290 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SSFA2P28290 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SSFA2P28290 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SSFA2P28290 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SSFA2P28290 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SSFA2P28290 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SSFA2P28290 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SSFA2P28290 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SSFA2P28290 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SSFA2P28290 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SSFA2P28290 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SSFA2P28290 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SSFA2P28290 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SSFA2P28290 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SSFA2P28290 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SSFA2P28290 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SSFA2P28290 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SSFA2P28290 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SSFA2P28290 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SSFA2P28290 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SSFA2P28290 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SSFA2P28290 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SSFA2P28290 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SSFA2P28290 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SSFA2P28290 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SSFA2P28290 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SSFA2P28290 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SSFA2P28290 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SSFA2P28290 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SSFA2P28290 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SSFA2P28290 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
SSFA2P28290 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SSFA2P28290 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SSFA2P28290 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SSFA2P28290 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SSFA2P28290 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SSFA2P28290 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SSFA2P28290 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SSFA2P28290 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms