Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
ERBB3P21860 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERBB3P21860 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERBB3P21860 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
ERBB3P21860 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ERBB3P21860 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
ERBB3P21860 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ERBB3P21860 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ERBB3P21860 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ERBB3P21860 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ERBB3P21860 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ERBB3P21860 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
ERBB3P21860 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERBB3P21860 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ERBB3P21860 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ERBB3P21860 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms