Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI3P19429 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI3P19429 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNI3P19429 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI3P19429 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNI3P19429 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3P19429 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3P19429 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI3P19429 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms