Protein–RNA interactions for Protein: P15812

CD1E, T-cell surface glycoprotein CD1e, membrane-associated, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1EP15812 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD1EP15812 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD1EP15812 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD1EP15812 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD1EP15812 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD1EP15812 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD1EP15812 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD1EP15812 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD1EP15812 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD1EP15812 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD1EP15812 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD1EP15812 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD1EP15812 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD1EP15812 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD1EP15812 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD1EP15812 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD1EP15812 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CD1EP15812 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD1EP15812 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CD1EP15812 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CD1EP15812 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD1EP15812 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD1EP15812 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CD1EP15812 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD1EP15812 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD1EP15812 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD1EP15812 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD1EP15812 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CD1EP15812 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CD1EP15812 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD1EP15812 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD1EP15812 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD1EP15812 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CD1EP15812 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CD1EP15812 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD1EP15812 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD1EP15812 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CD1EP15812 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CD1EP15812 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CD1EP15812 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD1EP15812 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CD1EP15812 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CD1EP15812 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD1EP15812 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CD1EP15812 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CD1EP15812 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD1EP15812 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD1EP15812 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD1EP15812 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD1EP15812 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD1EP15812 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD1EP15812 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD1EP15812 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD1EP15812 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD1EP15812 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD1EP15812 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD1EP15812 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD1EP15812 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD1EP15812 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD1EP15812 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD1EP15812 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD1EP15812 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD1EP15812 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD1EP15812 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD1EP15812 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD1EP15812 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD1EP15812 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD1EP15812 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD1EP15812 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CD1EP15812 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD1EP15812 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD1EP15812 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD1EP15812 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD1EP15812 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CD1EP15812 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CD1EP15812 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD1EP15812 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD1EP15812 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD1EP15812 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD1EP15812 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD1EP15812 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD1EP15812 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD1EP15812 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD1EP15812 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD1EP15812 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD1EP15812 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD1EP15812 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD1EP15812 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD1EP15812 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD1EP15812 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD1EP15812 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD1EP15812 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD1EP15812 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD1EP15812 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD1EP15812 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD1EP15812 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD1EP15812 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD1EP15812 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD1EP15812 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD1EP15812 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms