Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UMPSP11172 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UMPSP11172 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UMPSP11172 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UMPSP11172 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UMPSP11172 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UMPSP11172 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UMPSP11172 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UMPSP11172 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UMPSP11172 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UMPSP11172 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UMPSP11172 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UMPSP11172 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UMPSP11172 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UMPSP11172 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UMPSP11172 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UMPSP11172 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UMPSP11172 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UMPSP11172 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UMPSP11172 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UMPSP11172 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UMPSP11172 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UMPSP11172 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UMPSP11172 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UMPSP11172 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UMPSP11172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UMPSP11172 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UMPSP11172 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UMPSP11172 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UMPSP11172 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UMPSP11172 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UMPSP11172 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UMPSP11172 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UMPSP11172 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UMPSP11172 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UMPSP11172 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UMPSP11172 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UMPSP11172 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UMPSP11172 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UMPSP11172 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UMPSP11172 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UMPSP11172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UMPSP11172 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UMPSP11172 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UMPSP11172 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UMPSP11172 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UMPSP11172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UMPSP11172 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UMPSP11172 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UMPSP11172 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UMPSP11172 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UMPSP11172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UMPSP11172 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UMPSP11172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UMPSP11172 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UMPSP11172 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UMPSP11172 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UMPSP11172 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UMPSP11172 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UMPSP11172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UMPSP11172 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UMPSP11172 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UMPSP11172 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UMPSP11172 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UMPSP11172 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UMPSP11172 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UMPSP11172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UMPSP11172 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UMPSP11172 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UMPSP11172 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UMPSP11172 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UMPSP11172 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UMPSP11172 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UMPSP11172 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UMPSP11172 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UMPSP11172 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UMPSP11172 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UMPSP11172 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UMPSP11172 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UMPSP11172 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UMPSP11172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UMPSP11172 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UMPSP11172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UMPSP11172 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UMPSP11172 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UMPSP11172 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UMPSP11172 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UMPSP11172 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UMPSP11172 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UMPSP11172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UMPSP11172 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UMPSP11172 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UMPSP11172 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UMPSP11172 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UMPSP11172 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UMPSP11172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UMPSP11172 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UMPSP11172 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UMPSP11172 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UMPSP11172 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms