Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
C7P10643 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C7P10643 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C7P10643 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C7P10643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
C7P10643 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C7P10643 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C7P10643 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C7P10643 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C7P10643 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7P10643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C7P10643 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7P10643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7P10643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7P10643 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7P10643 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7P10643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7P10643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7P10643 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7P10643 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7P10643 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7P10643 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C7P10643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7P10643 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C7P10643 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C7P10643 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C7P10643 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C7P10643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C7P10643 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C7P10643 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C7P10643 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C7P10643 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C7P10643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C7P10643 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C7P10643 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C7P10643 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C7P10643 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C7P10643 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C7P10643 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C7P10643 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
C7P10643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C7P10643 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C7P10643 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C7P10643 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C7P10643 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C7P10643 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C7P10643 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C7P10643 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C7P10643 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C7P10643 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C7P10643 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C7P10643 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C7P10643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C7P10643 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C7P10643 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C7P10643 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C7P10643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7P10643 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7P10643 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7P10643 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C7P10643 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7P10643 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C7P10643 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7P10643 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7P10643 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C7P10643 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C7P10643 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7P10643 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C7P10643 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7P10643 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C7P10643 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C7P10643 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C7P10643 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7P10643 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7P10643 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C7P10643 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7P10643 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7P10643 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C7P10643 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7P10643 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7P10643 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7P10643 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C7P10643 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7P10643 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7P10643 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7P10643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7P10643 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C7P10643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C7P10643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C7P10643 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C7P10643 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C7P10643 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C7P10643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C7P10643 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C7P10643 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms