Protein–RNA interactions for Protein: P0DP07

IGHV4-31, Immunoglobulin heavy variable 4-31, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-31P0DP07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV4-31P0DP07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGHV4-31P0DP07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV4-31P0DP07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV4-31P0DP07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV4-31P0DP07 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV4-31P0DP07 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV4-31P0DP07 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV4-31P0DP07 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms