Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ROS1P08922 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ROS1P08922 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROS1P08922 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROS1P08922 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ROS1P08922 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ROS1P08922 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROS1P08922 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ROS1P08922 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROS1P08922 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ROS1P08922 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ROS1P08922 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ROS1P08922 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROS1P08922 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROS1P08922 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ROS1P08922 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROS1P08922 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ROS1P08922 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROS1P08922 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROS1P08922 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROS1P08922 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROS1P08922 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ROS1P08922 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROS1P08922 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROS1P08922 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROS1P08922 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROS1P08922 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROS1P08922 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROS1P08922 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ROS1P08922 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROS1P08922 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROS1P08922 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROS1P08922 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ROS1P08922 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROS1P08922 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROS1P08922 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROS1P08922 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROS1P08922 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROS1P08922 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROS1P08922 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROS1P08922 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROS1P08922 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROS1P08922 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROS1P08922 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROS1P08922 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROS1P08922 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROS1P08922 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROS1P08922 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROS1P08922 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROS1P08922 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROS1P08922 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROS1P08922 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROS1P08922 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROS1P08922 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROS1P08922 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROS1P08922 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROS1P08922 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROS1P08922 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROS1P08922 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROS1P08922 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROS1P08922 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ROS1P08922 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROS1P08922 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROS1P08922 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROS1P08922 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROS1P08922 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROS1P08922 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROS1P08922 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ROS1P08922 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROS1P08922 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROS1P08922 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ROS1P08922 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROS1P08922 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROS1P08922 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROS1P08922 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ROS1P08922 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROS1P08922 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ROS1P08922 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROS1P08922 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROS1P08922 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ROS1P08922 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ROS1P08922 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROS1P08922 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROS1P08922 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROS1P08922 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROS1P08922 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ROS1P08922 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ROS1P08922 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ROS1P08922 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROS1P08922 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ROS1P08922 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROS1P08922 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROS1P08922 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROS1P08922 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ROS1P08922 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms