Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HSP90AB1P08238 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HSP90AB1P08238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
HSP90AB1P08238 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
HSP90AB1P08238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HSP90AB1P08238 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HSP90AB1P08238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HSP90AB1P08238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HSP90AB1P08238 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
HSP90AB1P08238 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HSP90AB1P08238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HSP90AB1P08238 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
HSP90AB1P08238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms