Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
HSP90AB1P08238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
HSP90AB1P08238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
HSP90AB1P08238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
HSP90AB1P08238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
HSP90AB1P08238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HSP90AB1P08238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
HSP90AB1P08238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
HSP90AB1P08238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
HSP90AB1P08238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
HSP90AB1P08238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
HSP90AB1P08238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
HSP90AB1P08238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
HSP90AB1P08238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
HSP90AB1P08238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
HSP90AB1P08238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
HSP90AB1P08238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
HSP90AB1P08238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
HSP90AB1P08238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
HSP90AB1P08238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
HSP90AB1P08238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
HSP90AB1P08238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
HSP90AB1P08238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
HSP90AB1P08238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
HSP90AB1P08238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
HSP90AB1P08238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
HSP90AB1P08238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HSP90AB1P08238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
HSP90AB1P08238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
HSP90AB1P08238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HSP90AB1P08238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
HSP90AB1P08238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
HSP90AB1P08238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
HSP90AB1P08238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
HSP90AB1P08238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
HSP90AB1P08238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HSP90AB1P08238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
HSP90AB1P08238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HSP90AB1P08238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HSP90AB1P08238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
HSP90AB1P08238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HSP90AB1P08238 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
HSP90AB1P08238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HSP90AB1P08238 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HSP90AB1P08238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HSP90AB1P08238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
HSP90AB1P08238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
HSP90AB1P08238 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
HSP90AB1P08238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
HSP90AB1P08238 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
HSP90AB1P08238 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
HSP90AB1P08238 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
HSP90AB1P08238 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
HSP90AB1P08238 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
HSP90AB1P08238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
HSP90AB1P08238 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
HSP90AB1P08238 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
HSP90AB1P08238 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
HSP90AB1P08238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
HSP90AB1P08238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
HSP90AB1P08238 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
HSP90AB1P08238 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
HSP90AB1P08238 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
HSP90AB1P08238 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
HSP90AB1P08238 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms