Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
HSP90AB1P08238 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HSP90AB1P08238 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
HSP90AB1P08238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
HSP90AB1P08238 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HSP90AB1P08238 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HSP90AB1P08238 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
HSP90AB1P08238 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HSP90AB1P08238 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
HSP90AB1P08238 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HSP90AB1P08238 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HSP90AB1P08238 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
HSP90AB1P08238 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HSP90AB1P08238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HSP90AB1P08238 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HSP90AB1P08238 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB1P08238 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HSP90AB1P08238 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HSP90AB1P08238 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HSP90AB1P08238 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HSP90AB1P08238 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB1P08238 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HSP90AB1P08238 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HSP90AB1P08238 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
HSP90AB1P08238 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HSP90AB1P08238 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HSP90AB1P08238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HSP90AB1P08238 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HSP90AB1P08238 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
HSP90AB1P08238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
HSP90AB1P08238 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HSP90AB1P08238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
HSP90AB1P08238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HSP90AB1P08238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms