Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHOP08100 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RHOP08100 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RHOP08100 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RHOP08100 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RHOP08100 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RHOP08100 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RHOP08100 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOP08100 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOP08100 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RHOP08100 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RHOP08100 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RHOP08100 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RHOP08100 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RHOP08100 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOP08100 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOP08100 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOP08100 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RHOP08100 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOP08100 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RHOP08100 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHOP08100 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RHOP08100 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RHOP08100 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOP08100 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RHOP08100 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RHOP08100 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RHOP08100 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RHOP08100 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RHOP08100 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RHOP08100 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RHOP08100 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOP08100 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RHOP08100 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOP08100 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RHOP08100 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOP08100 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RHOP08100 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RHOP08100 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHOP08100 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RHOP08100 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RHOP08100 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHOP08100 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHOP08100 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RHOP08100 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RHOP08100 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RHOP08100 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOP08100 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOP08100 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOP08100 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RHOP08100 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOP08100 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOP08100 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RHOP08100 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOP08100 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOP08100 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOP08100 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RHOP08100 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RHOP08100 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RHOP08100 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RHOP08100 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOP08100 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RHOP08100 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RHOP08100 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RHOP08100 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RHOP08100 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RHOP08100 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RHOP08100 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RHOP08100 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOP08100 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RHOP08100 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOP08100 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RHOP08100 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOP08100 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOP08100 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOP08100 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RHOP08100 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RHOP08100 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOP08100 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHOP08100 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOP08100 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOP08100 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHOP08100 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOP08100 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOP08100 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms