Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MT-ND1P03886 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MT-ND1P03886 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MT-ND1P03886 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MT-ND1P03886 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MT-ND1P03886 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MT-ND1P03886 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MT-ND1P03886 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MT-ND1P03886 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms